Kalurahan Pagerharjo merupakan sebuah desa yang terletak di wilayah administratif Kapanewon Samigaluh, Kabupaten Kulon Progo. Wilayah Kalurahan Pagerharjo berbatasan dengan Kabupaten Magelang di sebelah Utara, Desa Ngargosari di sebalah Selatan, Desa Banjarsari di sebelah Barat, dan Kabupaten Purworejo di sebelah Timur. Kalurahan Pagerharjo berjarak 6 km dari ibukota Kapanewon Samigaluh, dengan luas desa 1.069, 5115 Ha atau 16,46% dari total luas Kapanewon Samigaluh, desa ini terdiri dari 20 Pedukuhan dengan jumlah RT : 87 dan RW : 43. Berikut merupakan rincian padukuhan di Kalurahan Pagerharjo: 

1. Dusun Separang 
2. Dusun Sarigono
3. Dusun Ngemplak
4. Dusun Plono Barat
5. Dusun Plono Timur
6. Dusun Nglinggo Barat
7. Dusun Nglinggo Timur 
8. Dusun Jobolawang
9. Dusun Ngaglik
10. Dusun Gegerbajing 
11. Dusun Kemesu
12. Dusun Ngentak
13. Dusun Sinogo
14. Dusun Kalirejo Utara
15. Dusun Kalirejo Selatan
16. Dusun Kalinongko
17. Dusun Jetis
18. Dusun Beteng
19. Dusun Suren
20. Dusun Mendolo

Nama Pagerharjo ada setelah sebelumnya berdiri tiga pemerintahan Desa/Kelurahan, yaitu Kelurahan Plono dipimpin oleh Simbah Kariyo Sentono, Kalurahan Gegerbajing dipimpin oleh Simbah R. Dermo, dan Kelurahan Kalirejo dipimpin oleh Simbah R. Udoikromo, sampai dengan tahun 1948. Berdasarkan hal tersebut di atas maka lahirlah gagasan dan pemikiran dari para tokoh, baik tokoh agama, tokoh adat, tokoh masyarakat, dan semua elemen masyarakat untuk menggabung tiga Kelurahan tersebut menjadi satu Kelurahan dan satu Pimpinan/Lurah yaitu Simbah Kariyo Sentono. Dari ketiga Kelurahan tersebut akhirnya digabung menjadi satu Kelurahan dan nama Kelurahan diambilkan dari huruf-huruf tertentu dari tiga Kelurahan yaitu P dari Plono, GER dari Gegerbajing, dan JO dari Kalirejo, sehingga tersusunlah sebuah nama PAGERHARJO yang berarti Desa yang ramai dan kaya.